آب نارگیل به دلیل داشتن املاح و مواد معدنی مهم شامل پتاسیم و منیزیم، خطر تشکیل سنگ کلیه را کاهش می دهد. به همین دلیل پزشکان به افرادی که کلیه های سنگ ساز دارند توصیه می کنند تا برای کوچک کردن سنگ های کلیه و دفع راحت آن ها از این نوشیدنی استفاده کنند.